Esempi di statistica descrittiva e inferenziale/Analisi del proprio genoma: differenze tra le versioni

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{{Esempi di statistica descrittiva e inferenziale}}
== Installazione librerie==
<syntaxhighlight lang="rsplus">
install.packages("BiocManager")
BiocManager::install("gwascat")
</syntaxhighlight>
 
==Caricamento librerie==
<syntaxhighlight lang="rsplus">
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library(ggplot2)
library(stringr)
</syntaxhighlight>
 
<syntaxhighlight lang="rsplus">
install.packages("BiocManager")
BiocManager::install("gwascat")
library(gwascat)
</syntaxhighlight>
 
 
== Parte 1: Dati ==
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E' possibile scaricare un dataset di links a pubblicazioni scientifiche relative ad SNP contenenti l' [[w:Allele|allele]] di rischio collegato ad una certa malattia o predisposizione. Ad esempio nell'SNP rs533123 l'allele di rischio potrebbe essere A per cui bisogna indagare se il proprio genotipo relativo a quell'SNP lo contiene.
Quindi unendo i 2 datasets si potrà sapere se il proprio genotipo contiene quel particolare allele di rischio relativo ad unauno specificaspecifico tratto o malattia.
 
 
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[[File:Numero totale di SNP per cromosoma nel genoma fornito.png|frame|centro]]
 
E' possibile cercare nel sito https://www.snpedia.orgcom/ gli SNP relativi ad una certa malattia o predisposizionetratto e cercarli nel genoma del signore . Ad esempio relativamente al rischio alcolico questo è l'SNP del signore:
 
<syntaxhighlight lang="rsplus">