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Esempi di statistica descrittiva e inferenziale/Analisi del proprio genoma: differenze tra le versioni

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Riga 214:
geom_text(aes(label=total), hjust=0, size=2)+
guides(fill=FALSE)+
ylab("Numero totale di SNPpubblicazioni") +
xlab("MalattiaTratto di malattia") +
ggtitle("Numero di SNPpubblicazioni con singolo allele di rischio per malattia",subtitle = "per tratto di malattia maggiore di 100 nel genoma umano fornito")
</syntaxhighlight>
 
Riga 232:
geom_text(aes(label=total), hjust=0, size=2)+
guides(fill=FALSE)+
ylab("Numero totale di SNPpubblicazioni") +
xlab("MalattiaTratto di malattia") +
ggtitle("Numero di SNPpubblicazioni con doppioDOPPIO allele di rischio per malattia",subtitle = "per tratto di malattia maggiore di 50100 nel genoma umano fornito")
</syntaxhighlight>
 
Riga 240:
 
Per ogni SNP si può leggere lo studio fornito tramite il suo link o cercarlo su SNPedia ...
 
Ad esempio per la schizofrenia :
<syntaxhighlight lang="rsplus">
df1 %>%
filter(DISEASE.TRAIT=="Schizophrenia") %>%
select(DISEASE.TRAIT, STRONGEST.SNP.RISK.ALLELE, genotype,STUDY) %>%
head()
</syntaxhighlight>
 
<small>DISEASE.TRAIT STRONGEST.SNP.RISK.ALLELE genotype
1 Schizophrenia rs533123-A AA
2 Schizophrenia rs3001723-A AA
3 Schizophrenia rs1198588-T TT
4 Schizophrenia rs1389724-T TT
5 Schizophrenia rs7521837-T TT
6 Schizophrenia rs7527939-C CC
STUDY
1 Genome-wide association study of schizophrenia in Ashkenazi Jews.
2 Genome-wide association study of schizophrenia in Ashkenazi Jews.
3 Genome-wide association analysis identifies 13 new risk loci for schizophrenia.
4 Genome-wide association study of schizophrenia in Ashkenazi Jews.
5 Genome-wide association study of schizophrenia in Ashkenazi Jews.
6 Whole-genome-wide association study in the Bulgarian population reveals HHAT as schizophrenia susceptibility gene.</small>
 
 
 
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